O PELD RIO PARAÍBA INTEGRADO (PELD- RIPA) está fundamentado em três condicionantes-chave, vistos no esquema ao lado contemplando assim 9 linhas temáticas:

• Dinâmica de populações e organização de comunidades e ecossistemas, visando a conservação da diversidade biológica;
• Padrões e frequência de perturbações naturais e impactos antrópicos e seus efeitos sobre populações, comunidades e ecossistemas, além dos padrões de invasão de espécies exóticas;
• Efeitos das mudanças climáticas sobre as comunidades biológicas terrestres e aquáticas, bem como a qualidade hídrica;
• Serviços ecossistêmicos;
• Educação ambiental, educação e popularização científica;
• Restauração ecossistêmica;
• Transposição inter e intra-bacias hidrográficas;
• Saúde ambiental e da população humana;
• Monitoramento e proposta de modelos para a gestão da bacia.